学位与研究生教育方面，学校高度重视。

1979年，学校被国务院学位委员会批准面向全国招收和培养硕士学位研究生;1981年，被批准为首批硕士学位授予单位。

现有中医学、中药学、中西医结合、药学、基础医学、临床医学、马克思主义理论等7个硕士学位授权一级学科，涵盖53个硕士学位授权学科、专业，另有2个自主设置二级学科(医事管理、药事管理)。

河南中医学院研究生培养

1997年起相继与北京中医药大学、上海中医药大学、中国中医科学院等联合培养博士研究生。

2003年被教育部正式批准为联合培养博士研究生工作单位，2006年被人事部批准为博士后科研工作站，2009年1月被确定为博士学位授权建设单位，2013年7月，中医学、中药学两个一级博士授权学科获得河南省和国务院学位办正式批准，2014年中医学、中药学开始招收博士研究生。

学校下设3所集教学、医疗、科研为一体的直属附属医院，具有完善的教学辅助体系，拥有一支数十名国家级、省级名老中医领衔实力雄厚的中医医疗、教学、科研队伍。

其中，第一附属医院为全国三级甲等中医院、全国示范中医院、全国百佳医院，是河南省规模最大、建院最早的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级综合性中医医院，是国家中医临床研究基地、国家中医药国际交流合作基地，设有博士后科研工作站，特别是在中医药治疗艾滋病、慢性阻塞性肺病(COPD)、老年病、心脑血管病、儿科疾病、周围血管病、肛肠病等方面在全国有较大影响。

第二附属医院又是河南省中医院，为国家临床中医师培训基地，是一所现代化综合性三级甲等中医院;第三附属医院以针灸推拿为主，在治疗脊柱病、内科杂症方面特色突出。

3所附属医院开设床位4112张，年均门诊量316.1余万人次，年出院病人8.6余万人次;面向全省乃至全国已培训各类人员1.66余万人次，帮助和促进了基层医疗卫生服务水平的提升;有国家级重点专科(专病)33个、省级重点专科16个。

河南中医学院实践教学

教学实验室根据功能划分设立了5个综合实验实训中心，下设17个基础实验实训平台，168个实验实训室;有6个省级实验教学示范中心、1个省级虚拟仿真实验教学中心。

拥有5所非直属附属医院(洛阳正骨医院、郑州市中医院、安阳市中医院、开封市中医院、濮阳市中医院)和125个临床教学基地。

图书馆各类图书115.3万册，中外文期刊1515种，有中国知网(CNKI)、维普中文科技期刊数据库等数据库43个，特别是馆藏的中医线装古籍文献尤为丰富，收藏量居全国中医药院校前列。

教学仪器设备、教室、宿舍、食堂和运动场地等能很好地满足教育教学需要。

坚持教学与科研并重，加强科研机构建设，创新科研管理机制，广泛开展多渠道、多层次的科研活动。

现有科技部国际科技合作基地、国家中医临床研究基地、国家中医药管理局中医药国际合作基地、河南省高校人文社科基地、河南省非物质文化遗产研究基地、博士后科研工作站、河南省高校人文社科重点研究基地、河南省全科医生培养基地、世界针灸联合会教育基地等大型研究平台，2个国家中医药管理局重点研究室，6个国家中医药管理局三级实验室，1个省级协同创新中心，2个河南省重点实验室，2个河南省工程技术中心，1个产学研共建工程研发创新平台，3个河南省高校工程技术研究中心，3个河南省高校重点实验室培育基地，3个河南省高校重点学科开放实验室，3个郑州市重点实验室，59个校级研究所(中心)和13个校级研究室。

学校有分析测试中心、药理药效实验中心、中医药分子生物实验中心、病理实验中心、动物实验中心、院士实验室(医学免疫学重点实验室)等6个公共科研平台及中医内科重点学科开放实验室。

近5年来，学校在科学研究方面取得了显著进步，5年来共承担科研项目863项，其中“十一五”国家科技支撑计划、“十二五”国家科技支撑计划、国家自然科学基金重点项目、国家软科学等国家级项目88项，省部级项目257项;获国家科学技术进步二等奖1项，获国家科学技术进步二等奖2项，省部级科研奖励86项;获国家授权专利217项;发表学术论文9402篇，被SCI、EI、ISTP等收录216篇;出版学术专著(译著)、教材共计604部。