2001年经教育部批准，与原西南农业大学、中国农科院柑桔研究所合并组建新的西南农业大学，设立荣昌校区。

2005年7月，西南农业大学与西南师范大学合并组建西南大学，校区更名为西南大学荣昌校区。

校区位于“中国畜牧科技城”、重庆国家现代畜牧业示范区核心区、国家卫生城市、文明县城、园林县城、重庆市区域中心城市――荣昌县城，距重庆主城仅88公里。交通便利，处于成渝高速公路和成渝铁路中段，2014年通车的成渝高铁荣昌站已开工建设。

校区是重庆市园林式单位，环境优美。

占地462亩、校舍建筑面积14.3万平方米。

仪器设备总值5400余万元，图书馆藏书36万余册，数字资源48.72万册，并与本部实现VPN链接。

全日制在校本科学生4200余人，硕士研究生120余人;各类成人教育、函授教育、校外办学点学生1500余人。

在职教职工近500人，其中教授、副教授等高级职称120余人，硕士生导师36人。

具有硕、博学位者占专任教师的70%;教师中有农业部兽药审评委员会委员、重庆市学术带头人、重庆市高校中青年骨干教师、重庆市322人才工程、省部级中青年突贡专家、重庆市优秀教师。

西南大学科研设施

校区设有中国畜牧科技城兽药研发检测技术中心、动物疾病快速诊断防治中心、畜禽健康养殖技术中心、名优鱼类养殖技术中心、牧医渔业管理软件研发中心、牧医渔业经济研究中心、牧医渔业信息咨询司法鉴定中心、牧医渔业人才培训中心。

拥有川牧饲料总厂、科信动物药品厂、实习牧场、实习渔场、动物医院、标本厂、计算机中心、电子政务、电子商务、物流市场等设施齐全的校内教学实习场所。

2004年与荣昌8家大型GMP兽药企业建立了“8+1”校企联合体，实现资源共享，互利双赢。还与川渝两地多家企事业单位、政府部门建立了长期友好合作关系，开辟了师生校外教学实验实习基地。

西南大学学科建设

校区目前设有动物科学系、动物医学系、水产系、商贸系、信息管理系、基础部和成教部等教学单位。开设有动物科学、动物医学、水产养殖学、计算机科学与技术、信息管理与信息系统、市场营销、公共事业管理、食品科学与工程(畜产品加工及贮藏工程方向)、动物药学、水族科学与技术共10个普通本科专业和7个硕士专业。

预防兽医学、临床兽医学为省部级重点学科;淡水鱼类养殖学、中兽医药物学、畜产品加工学、动物传染病学、动物遗传学为省部级重点课程;畜产品加工学为市级精品课程。

初步形成了以畜牧、兽医、水产为主，覆盖牧渔业产前、产中、产后各环节，多学科、多层次、多形式的办学格局。

校区近年来承担了一批国家、省市重大科研、技术推广课题，20多项科研成果获得国家、省部级科技奖励，10余项获国家发明专利。

其中小鹅瘟、猪丹毒、猪伪狂犬病检测方法等被农业部列为全国动物疫病检测规程;王永才教授主持的“植根西部畜牧业沃土，培养高素质创业人才”成果荣获第六届高等教育国家级教学成果二等奖;左福元教授主持的国家科技部十五重大专项“肉牛养殖与草场建设关键技术研究与示范”通过鉴定验收，以他为首席科学家的重庆市十一五重大科技专项“草食畜牧良种繁育与健康养殖”国拨经费达1000万元;黄伟博士研制的鸡传染病法氏囊精制卵黄抗体获国家生物制品二类新兽药证书;郑曙明教授等发现并命名了鱼类新物种――武隆丽条鳅;尹华贵副教授牵头的课题组成功培育了重庆市第一个家禽地方品种――渝西乌鸡。

校区在70多年的办学历程中，始终坚持以为地方经济建设服务为宗旨，走出了一条立足川渝、辐射西南、放眼全国的特色办学之路。

共为社会输送人才60000余名，毕业生遍布全国各地。